对于处于生育期的女性，检查可能包括：
妊娠试验
血检测量激素水平
检查生殖系统的影像学检查或程序（如超声或宫腔镜检查）
有时使用激素药物来确定它们是否会触发月经期
有时甚至对没来过月经或没有过性活动的女孩进行妊娠测试。如果排除怀孕，则根据检查结果和可疑病因做其他的检查。
如果女孩从未有过月经（原发性闭经）但有正常的第二性征，检查从激素血液检查、体格检查和超声开始，以查明可能阻碍月经血流出子宫的出生缺陷。如果出生缺陷不常见或难以识别，可以进行磁共振成像 (MRI)。
检查通常是按顺序进行的，病因就在这个过程中被确定或排除。如果症状指向一个特殊疾病，那么首先要做针对性检查。比如，如果女性有头疼或视力异常，应该做头颅MRI以检查是否有脑垂体肿瘤。根据之前的检查结果来决定是否要做额外的检查以及做哪些检查。典型检查包括：
做血检测量特定激素含量，包括催乳素（以检查影响月经期的高水平催乳素）、甲状腺激素（以检查甲状腺疾病）、卵泡刺激素（以检查脑垂体或下丘脑功能问题）以及雄性激素（以检查造成男性性征加强的疾病）
对腹部和盆腔行影像学检查，以寻找卵巢或肾上腺中的肿瘤（通常为超声，但有时为计算机断层扫描 [CT] 或 MRI）
对组织样本（比如血液样本）做染色体检查，以确定是否有遗传疾病
进行观察子宫或输卵管内部的操作（宫腔镜检查或子宫输卵管造影术），以检查这些器官中的堵塞和其他异常
使用激素（雌激素和孕激素或孕酮）来尝试引发月经出血
进行宫腔镜检查时，医生将一根细的显像管插入阴道和子宫颈来观察子宫内部。这个检查可以在医生的诊所进行，或作为门诊检查在医院进行。
进行子宫输卵管造影术时，通过子宫颈向子宫和输卵管注入一种可以在 X 光上看到的物质（一种不透射线的造影剂），然后进行 X 光检查。子宫输卵管造影术通常在医院放射科门诊进行。
激素（孕激素或雌激素加孕激素）可口服，用以尝试引发月经出血。如果激素触发月经出血，原因可能是控制月经期的激素系统功能障碍或过早绝经。如果激素没有触发出血，那么病因可能是子宫疾病或器质性异常阻止经血流出。